Bon j'ai réussi à remettre en place mon wiki et ma liste de cadeau. Par contre impossible de refaire fonctionner les liens symboliques. Parce que ces 2 sites sont générés avec hugo, et sur le serveur précédent y avait un lien symbolique vers /var/www/... pour appliquer les mises à jours en générant le code html dans le dossier public du projet. Mais là je sais pas pourquoi, nginx fait son relou et il veut pas lire le contenu du dossier. Du coup j'ai fait un copié collé des fichiers et ça fonctionne. J'avais aussi essayé de changer le dossier de génération, pour qu'il pointe vers le dossier lu par nginx mais là c'est hugo qui a pas les permissions d'écrire dedans.
En tout cas c'est un casse tête pour lequel j'ai passé trop de temps donc pour le moment ça ira très bien comme ça.